# Microfaune - extraction Baermann ## Résumé La méthode de Baermann permet d'extraire la microfaune d'un sol afin de réaliser une analyse des populations de nématodes et d'enchytréides. ## Question posée ***Quelle est la population de nématodes de mon sol ? Ai-je trop de nématodes phytophages ? Ai-je un bon équilibre des populations de nématodes dans mon sol ?*** ## Source J. Trap, 2020. Les nématodes des sols. Webinaire 4 juin 2020, AFES. Chargé de recherche IRD, UMR Eco\&Sol, Montpellier. ## Principe Une nouvelle méthode d'extraction de nématodes et autres organismes appartenant à la microfaune est proposée par un certain monsieur Baermann en 1917. Un échantillon de sol est mis en suspension dans de l'eau, les nématodes passent à travers un filtre et se trouvent dans l'eau. Un entonnoir à embout fermé puis ouvert permet de récupérer cette eau pour analyser par la suite les individus se trouvant dedans. ## Condition de mise en œuvre **Quand ?**\ Il est idéal de prendre un échantillon entre **mars et juin**, sur un sol qui n'est pas gelé, pas détrempé, ni trop chaud ni trop sec. L'analyse au laboratoire doit suivre le prélèvement car les individus doivent être vivants. {% hint style="info" %} *Prévoyez de réaliser la manipulation au laboratoire le matin, car la pause doit être de 6 à 8h. Sinon, faites cette manipulation le soir et observez les nématodes le lendemain matin.* {% endhint %} **Où ?**\ L'échantillon de sol frais (pas plus d'une semaine) doit être mis en suspension et analysé **au laboratoire**. ## Matériel #### Matériel terrain (pour un échantillon) * Un bocal ou sachet congélation (pour contenir l'échantillon de sol) * Une petite pelle * Un feutre permanent #### Matériel laboratoire * Entonnoir * Tamis d'un diamètre légèrement inférieur au diamètre de l'entonnoir (doit se poser à l'intérieur) * Tissu filtrant (filtre à thé, tissu mousseline, voile) * Potence (doit tenir l'entonnoir) * Tuyau souple pouvant s'insérer autour de l'entonnoir * Clamp * Bocal * Eau tiède * Lames * Lamelles * Microscope * Pipette ![Dispositif de l'entonnoir fermé - méthode de Baermann](/files/-MKsiHvt7RdCxOeuOAzr) ## Réalisation du protocole #### Prélèvement de l'échantillon Dans un bocal, un sachet congélation ou autre (selon le lieu de l'analyse et si l'échantillon doit être envoyé ou non par colissimo), prélevez 500g du sol que vous souhaitez analyser. #### Au laboratoire 1. Placez sur la potence l'entonnoir raccordé au tuyau souple, fermé par le clamp (faites un test à blanc en remplissant d'eau le système, le tout doit être bien étanche) 2. Placez le bocal dessous 3. Enlevez l'eau d'essai et videz le bocal 4. Si le tout est étanche, prélevez une partie de votre échantillon de terre (frais, pas plus d'une semaine) 5. Placez le sur le filtre tissu ou filtre à thé (la maille ne doit pas excéder 500 µm = 0,5 mm) 6. Placez l'échantillon et le tissu sur le tamis et posez le tout dans l'entonnoir 7. Ajoutez de l'eau tiède jusqu'à ce que la terre soit en contact avec (ne pas l'immerger complètement) 8. Vérifiez que le tout soit étanche. {% hint style="info" %} *Laissez poser le tout 6 à 8h, les nématodes vont être attirées dans l'eau.* {% endhint %} Après la pause, ouvrez le clamp. Montez entre lame et lamelle l'eau dans le bocal à l'aide d'une pipette et observez les individus au microscope. N'hésitez pas à réaliser plusieurs lames pour avoir vu le maximum d'individus. Observez les appareils buccaux des nématodes, distinguez-les selon leur régime alimentaire et comptez les individus selon la clés d'identification. {% file src="/files/-MLS3h4o1iL-VuFRrYqR" %} A IMPRIMER : fiche laboratoire (matériel, étapes, tables résultats, clé d'identification) {% endfile %} ## Pour identifier les individus Pour l'identification des individus piégés, voir l'onglet : [Identification de la faune du sol](/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/les-cles-didentification-de-la-faune.md) > [Les nématodes](/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/les-cles-didentification-de-la-faune/details-sur-les-grands-groupes/les-nematodes.md) ## Interprétation des données Les populations de nématodes sont de très bons indicateurs de la santé du sol et de la culture associée à ce dernier. Certaines nématodes sont phytophages, elles vont donc s'attaquer probablement à la culture. Certaines sont au contraire carnivores ou omnivores et peuvent s'avérer de véritables alliés afin de combattre les autres ravageurs de cultures. ## Références Vidéo Youtube du montage : En savoir plus sur les nématodes : Pour aller plus loin dans le monde des nématodes : --- # Agent Instructions: Querying This Documentation If you need additional information that is not directly available in this page, you can query the documentation dynamically by asking a question. Perform an HTTP GET request on the current page URL with the `ask` query parameter: ``` GET https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/extraction-baermann.md?ask= ``` The question should be specific, self-contained, and written in natural language. The response will contain a direct answer to the question and relevant excerpts and sources from the documentation. Use this mechanism when the answer is not explicitly present in the current page, you need clarification or additional context, or you want to retrieve related documentation sections.