Microfaune - extraction Baermann
B5 - Analyse des populations de nématodes et d'enchytréides du sol.
Résumé
La méthode de Baermann permet d'extraire la microfaune d'un sol afin de réaliser une analyse des populations de nématodes et d'enchytréides.
Question posée
Quelle est la population de nématodes de mon sol ? Ai-je trop de nématodes phytophages ? Ai-je un bon équilibre des populations de nématodes dans mon sol ?
Source
J. Trap, 2020. Les nématodes des sols. Webinaire 4 juin 2020, AFES. Chargé de recherche IRD, UMR Eco&Sol, Montpellier.
Principe
Une nouvelle méthode d'extraction de nématodes et autres organismes appartenant à la microfaune est proposée par un certain monsieur Baermann en 1917. Un échantillon de sol est mis en suspension dans de l'eau, les nématodes passent à travers un filtre et se trouvent dans l'eau. Un entonnoir à embout fermé puis ouvert permet de récupérer cette eau pour analyser par la suite les individus se trouvant dedans.
Condition de mise en œuvre
Quand ? Il est idéal de prendre un échantillon entre mars et juin, sur un sol qui n'est pas gelé, pas détrempé, ni trop chaud ni trop sec. L'analyse au laboratoire doit suivre le prélèvement car les individus doivent être vivants.
Prévoyez de réaliser la manipulation au laboratoire le matin, car la pause doit être de 6 à 8h. Sinon, faites cette manipulation le soir et observez les nématodes le lendemain matin.
Où ? L'échantillon de sol frais (pas plus d'une semaine) doit être mis en suspension et analysé au laboratoire.
Matériel
Matériel terrain (pour un échantillon)
Un bocal ou sachet congélation (pour contenir l'échantillon de sol)
Une petite pelle
Un feutre permanent
Matériel laboratoire
Entonnoir
Tamis d'un diamètre légèrement inférieur au diamètre de l'entonnoir (doit se poser à l'intérieur)
Tissu filtrant (filtre à thé, tissu mousseline, voile)
Potence (doit tenir l'entonnoir)
Tuyau souple pouvant s'insérer autour de l'entonnoir
Clamp
Bocal
Eau tiède
Lames
Lamelles
Microscope
Pipette
Réalisation du protocole
Prélèvement de l'échantillon
Dans un bocal, un sachet congélation ou autre (selon le lieu de l'analyse et si l'échantillon doit être envoyé ou non par colissimo), prélevez 500g du sol que vous souhaitez analyser.
Au laboratoire
Placez sur la potence l'entonnoir raccordé au tuyau souple, fermé par le clamp (faites un test à blanc en remplissant d'eau le système, le tout doit être bien étanche)
Placez le bocal dessous
Enlevez l'eau d'essai et videz le bocal
Si le tout est étanche, prélevez une partie de votre échantillon de terre (frais, pas plus d'une semaine)
Placez le sur le filtre tissu ou filtre à thé (la maille ne doit pas excéder 500 µm = 0,5 mm)
Placez l'échantillon et le tissu sur le tamis et posez le tout dans l'entonnoir
Ajoutez de l'eau tiède jusqu'à ce que la terre soit en contact avec (ne pas l'immerger complètement)
Vérifiez que le tout soit étanche.
Laissez poser le tout 6 à 8h, les nématodes vont être attirées dans l'eau.
Après la pause, ouvrez le clamp. Montez entre lame et lamelle l'eau dans le bocal à l'aide d'une pipette et observez les individus au microscope. N'hésitez pas à réaliser plusieurs lames pour avoir vu le maximum d'individus. Observez les appareils buccaux des nématodes, distinguez-les selon leur régime alimentaire et comptez les individus selon la clés d'identification.
Pour identifier les individus
Pour l'identification des individus piégés, voir l'onglet : Identification de la faune du sol > Les nématodes
Interprétation des données
Les populations de nématodes sont de très bons indicateurs de la santé du sol et de la culture associée à ce dernier. Certaines nématodes sont phytophages, elles vont donc s'attaquer probablement à la culture. Certaines sont au contraire carnivores ou omnivores et peuvent s'avérer de véritables alliés afin de combattre les autres ravageurs de cultures.
Références
Vidéo Youtube du montage : https://www.youtube.com/watch?v=Fx5bvCy46cc
En savoir plus sur les nématodes : https://vimeo.com/425945028
Pour aller plus loin dans le monde des nématodes : https://nematode.unl.edu/index.html
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