# protocoles et observations - [Observations sur le terrain](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/observations-sur-le-terrain.md) - [Examen d'un profil de sol](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/observations-sur-le-terrain/examen-dun-profil-de-sol.md): Quelques consignes pour réaliser l'observation d'un sol - [Prélèvement d'échantillons](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/observations-sur-le-terrain/prelevement.md): Consignes pour réaliser des prélèvements d'échantillons. - [Maintenance de la structure](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/maintenance-de-la-structure.md) - [Infiltromètre Beerkan](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/maintenance-de-la-structure/mesure-de-linfiltration.md): M1- Infiltromètre Beerkan - [Infiltromètre Beerkan simplifié](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/maintenance-de-la-structure/mesure-de-linfiltration/infiltrometre-beerkan-simplifie.md): Mesure simplifiée de la capacité d'infiltration d'un sol - méthode Beerkan - [Compléments à la mesure Beerkan](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/maintenance-de-la-structure/mesure-de-linfiltration/complement-a-la-mesure-beerkan-simplifiee.md) - [Simulateur de pluie Cornell](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/maintenance-de-la-structure/simulateur-de-pluie-cornell.md): M2 - dispositif évaluant le ruissellement et l'infiltration - [Slake test](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/maintenance-de-la-structure/stabilite-des-agregats.md): M3 - Slake test ou test de battance réalisé au champ pour évaluer statistiquement la stabilité des agrégats face à l'immersion dans l'eau. - [Stabilité structurale](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/maintenance-de-la-structure/stabilite-structurale.md): M4 - Évaluation de la stabilité structurale des agrégats - [Porosité](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/maintenance-de-la-structure/porosite.md): M5 - Évaluation de la porosité par mesures de la densité apparente et réelle du sol - [Activité biologique](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique.md): Évaluation de l'activité du vivant dans l'écosystème sol - [Carbone du sol](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/carbone-du-sol.md) - [Carbone actif POXC](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/carbone-du-sol/carbone-actif-poxc.md): A4 - Mesure du carbone labile - [Carbone organique par calcination](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/carbone-du-sol/carbone-organique-par-calcination.md): A5 - Une mesure de la matière organique totale d'un échantillon de sol par la perte au feu (en anglais Loss on ignition) - [Carbone organique méthode Anne](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/carbone-du-sol/carbone-organique-methode-anne.md): A6 - méthode par oxydation forte et à la chaleur - [Respiration](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/respiration.md) - [Respiration par incubation - méthode générale](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/respiration/respiration-par-incubation.md): A8 - Mesure de la respiration des micro-organismes du sol par dosage de CO2 libéré en conditions standardisées par incubation. - [Respiration par incubation de 3 jours](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/respiration/respiration-par-incubation-de-3-jours.md): A9 - Mesure de la respiration des micro-organismes du sol par dosage de CO2 libéré en conditions standardisées par incubation. - [Respiromètre de paillasse](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/respiration/respirometre-de-paillasse.md): A14 Nous avons souhaité simplifier la mesure de l'émission du CO2 dans les chambres d'incubation à l'aide d'un capteur de CO2. - [Respiration - méthode SituResp®](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/respiration/respiration-methode-situresp-r.md): A10 - Méthode SituResp® extraite de Biofunctool - [Respiration in situ v1](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/respiration/respiration-du-sol.md): A11 - avec un dispositif déployé sur le terrain conçu par le Pecnot'Lab - [Respiration in situ v2](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/respiration/respiration-in-situ-v2.md): A12 - respiromètre du Pecnot Lab V2 - [Respiration méthode Draëger](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/respiration/respiration-methode-draeger.md): A 13 - méthode de l'USDA - [Litter bag](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/litter-bag.md) - [Litter bag méthode Pecnot'Lab](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/litter-bag/degradation-des-litieres.md): A1 - test de type litter bag (sac de litière) - [Litter bag - Forêt](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/litter-bag/litter-bag-foret.md): A2 - Technique d’étude de l’activité biologique du sol via la vitesse de dégradation de la litière forestière. - [Bait Lamina](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/degradation-de-la-cellulose.md): A3 - Test Bait lamina (baguette d'appâts) - [Glomaline](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/glomaline.md): A15 -Estimation de la richesse en champignons mycorhiziens d'un sol et de sa stabilité face à l'érosion par quantification de la glomaline, glycoprotéine produite par les mycéliums de ces champignons. - [FDA hydrolase](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/activite-biologique/evaluation-de-lactivite-microbienne-fda-hydrolase.md): A7 - Évaluation de l’activité microbienne par la mesure d’une activité enzymatique à large spectre - [Biocénoses](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses.md): Observation des espèces - [Test vers de terre - méthode moutarde](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/test-vers-de-terre.md): B1 - Evaluation de la quantité et les types de lombriciens du sol. - [Test vers de terre - méthode bêche](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/test-vers-de-terre-methode-beche.md): B2 - Évaluation de la quantité de lombriciens du sol et évaluation de la structure du sol. - [Etude des invertébrés de surface - Pitfall traps](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/pitfall-trap.md): B3 - Technique d'échantillonnage de la macrofaune et mésofaune marcheuse à la surface du sol par piégeage. - [Macrofaune et mésofaune - extraction Berlèse](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/extraction-berleze.md): B4 - Détermination de la mésofaune et macrofaune par un prélèvement d'échantillon de sol. - [Microfaune - extraction Baermann](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/extraction-baermann.md): B5 - Analyse des populations de nématodes et d'enchytréides du sol. - [Spores de champignons](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/spores-de-chanpignons.md): B6 - Approximation du potentiel mycorhizogène d'un sol par quantification du nombre de spores de champignons. - [Coloration des mycorhizes](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/spores-de-chanpignons-1.md): B7 - Observation de mycorhizes - extrait de l'article de Alix Helme -Guizon et Marc André Selosse (cf. § ressources) - [Identification de la faune du sol](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/les-cles-didentification-de-la-faune.md): La plupart du temps les observations sont faites à la loupe binoculaire ou au microscope, après extraction ou piégeage des individus du sol. - [La clé de détermination](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/les-cles-didentification-de-la-faune/la-macrofaune-et-la-mesofaune.md): Les premiers pas dans l'étude des individus qui peuplent les sols. - [Informations supplémentaires sur les groupes d'individus](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/les-cles-didentification-de-la-faune/details-sur-les-grands-groupes.md): Pour les plus curieux ou les plus aguerris. - [Les collemboles](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/les-cles-didentification-de-la-faune/details-sur-les-grands-groupes/les-collemboles.md): Description et identification des collemboles - [Les arachnides](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/les-cles-didentification-de-la-faune/details-sur-les-grands-groupes/les-arachnides.md): Description et identification des arachnides - [Les acariens](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/les-cles-didentification-de-la-faune/details-sur-les-grands-groupes/les-arachnides/focus-acariens.md): Description et identification des acariens - [Les vers : vers de terre et enchytréides](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/les-cles-didentification-de-la-faune/details-sur-les-grands-groupes/les-lombriciens.md): Description et identification des vers présents dans les sols. - [Les nématodes](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/les-cles-didentification-de-la-faune/details-sur-les-grands-groupes/les-nematodes.md): Les clés de détermination de leur groupe fonctionnel - [Les insectes](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/biocenoses/les-cles-didentification-de-la-faune/details-sur-les-grands-groupes/les-insectes-1.md): Quelques exemples d'insectes qu'on retrouve sur, et dans les sols. - [Disponibilité des nutriments](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/disponibilite-des-nutriments.md) - [Membrane échangeuse d'ions](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/disponibilite-des-nutriments/membrane-echangeuse-dions.md): D1 - Etude de la dynamique des nutriments disponibles dans le sol via l'utilisation d'une membrane absorbant facilement les nutriments en solution. - [Disponibilité de l'azote](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/disponibilite-des-nutriments/azote-disponible-du-sol.md): D2 - Mesure de la quantité d'azote disponible dans le sol. - [Caractéristiques physico-chimiques](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/caracteristiques-physico-chimiques.md) - [Texture - méthode pipette](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/caracteristiques-physico-chimiques/texture-methode-pipette.md): PC1 - Protocole de sédimentation par la méthode du tamis-pipette ( en anglais sieve-pipette method) - [Texture - méthode du bocal](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/caracteristiques-physico-chimiques/texture-methode-du-bocal.md): PC11 - Protocole d'estimation de la texture par une méthode simple mais peu précise - [Teneur en eau](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/caracteristiques-physico-chimiques/suivi-de-lhumidite.md): PC2 - [Suivi de l'humidité du sol](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/caracteristiques-physico-chimiques/humidite-mesure-ponctuelle.md): PC3 - Enregistrer l'évolution de l'humidité du sol avec un capteur et un logger électronique. - [pH eau](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/caracteristiques-physico-chimiques/mesure-du-ph.md): PC4 - Le pH représente la concentration d’ions H+ libre dans une solution. Il s’exprime selon une échelle allant de 0 à 14 soit d’un état acide à basique. La neutralité correspond à un pH = 7. - [pH KCl](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/caracteristiques-physico-chimiques/ph-kcl.md): PC 5 - Le pH KCl rend compte de la capacité d’échange de la solution d'un sol. - [pH méthode terrain](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/caracteristiques-physico-chimiques/ph-methode-terrain.md): PC 6 - une méthode simple avec des bandes de papier pH - [pH méthode chou rouge](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/caracteristiques-physico-chimiques/ph-methode-chou-rouge.md): PC 7 - méthode colorimétrique simple et peu couteuse à base de chou rouge - [Test carbonates](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/caracteristiques-physico-chimiques/test-carbonates.md): PC 8 - effervescence à l'acide - [SOC et SIC par calcination](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/caracteristiques-physico-chimiques/soc-et-sic-par-calcination.md): Mesure du carbone organique (SOC) et du carbone inorganique du sol (SIC) - [Mesure des carbonates](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/caracteristiques-physico-chimiques/mesure-des-carbonates.md): PC 9 - - [Capacité d'échange cationique](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/caracteristiques-physico-chimiques/capacite-dechange-cationique.md): PC 10 - Évaluation de la capacité du sol à retenir des éléments minéraux. - [Cas des sols hydromorphes](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes.md) - [Indice au pyrophosphate](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/indice-au-pyrophosphate.md): H1 - Protocole pour la caractérisation des tourbes - [Taux de fibres](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/taux-de-fibres.md): H2 - Permettent d'évaluer l'état de la dégradation des tourbes selon la granulométrie des particules organiques. - [Taux de fibres - méthode standard](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/taux-de-fibres/taux-de-fibres-methode-standard.md): H21 - Deux indices qui permettent d'évaluer l'état de la dégradation des tourbes selon la granulométrie des particules organiques. - [Taux de fibres - tourbe fraiche](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/taux-de-fibres/taux-de-fibres-tourbe-fraiche.md): H22 - Deux indices qui permettent d'évaluer l'état de la dégradation des tourbes selon la granulométrie des particules organiques. - [Taux de cendres](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/taux-de-cendres.md): H3 - Mesure du taux de cendre d'un échantillon par calcination - [Evaluation des traits réductiques](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/evaluation-des-traits-reductiques.md): H4 - [Identification au thiocyanate de potassium](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/evaluation-des-traits-reductiques/identification-au-thiocyanate-de-potassium.md): H41 - Mettre en évidence l’hydromorphie du sol à l’aide d’une méthode simple et rapide à effectuer sur le terrain. - [Identification à l'orthophénantroline](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/evaluation-des-traits-reductiques/identification-a-lorthophenantroline.md): H42 - test colorimétrique avec une solution de 1,10-phénantroline - [Identification du manganèse](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/evaluation-des-traits-reductiques/identification-du-manganese.md): H 43 - Mettre en évidence la présence de concrétions ferro-manganiques dans le sol à l’aide de méthode simple et rapide à effectuer sur le terrain. - [Mesure des nappes](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes.md): H5 - [Piézomètre data logger](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes/piezometre-data-logger.md): H51 - [Principe](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes/piezometre-data-logger/principe.md) - [Matériel](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes/piezometre-data-logger/materiel.md) - [Installation & maintenance](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes/piezometre-data-logger/installation-and-maintenance.md) - [Le puits](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes/piezometre-data-logger/installation-and-maintenance/le-puits.md) - [Paramétrage de la sonde](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes/piezometre-data-logger/installation-and-maintenance/parametrage-de-la-sonde.md) - [Maintenance](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes/piezometre-data-logger/installation-and-maintenance/maintenance.md) - [Collecte des données](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes/piezometre-data-logger/collecte-des-donnees.md) - [Sondes TD-Diver](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes/piezometre-data-logger/collecte-des-donnees/sondes-td-diver.md) - [Sonde DIY PecnotLab](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes/piezometre-data-logger/collecte-des-donnees/sonde-diy-pecnotlab.md) - [Piezo Eiwa Connect](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes/piezometre-data-logger/collecte-des-donnees/piezo-eiwa-connect.md): capteur piézométrique connecté en Wifi alimenté par un panneau solaire - [Traitement des données](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes/piezometre-data-logger/traitement-des-donnees.md) - [Piézomètre manuel](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/mesure-des-nappes/piezometre-manuel.md): H52 - [Conductivité hydraulique horizontale](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/conductivite-hydraulique-horizontale.md): H6 - [Évaluation de la dénitrification](https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations/cas-des-sols-hydromorphes/evaluation-de-la-denitrification.md): H7 dénitrification dans les sols saturés en eau --- # Agent Instructions: Querying This Documentation If you need additional information that is not directly available in this page, you can query the documentation dynamically by asking a question. Perform an HTTP GET request on the current page URL with the `ask` query parameter: ``` GET https://rhizobiome.gitbook.io/les-tutoriels-du-pecnotlab/protocoles-et-observations.md?ask= ``` The question should be specific, self-contained, and written in natural language. The response will contain a direct answer to the question and relevant excerpts and sources from the documentation. Use this mechanism when the answer is not explicitly present in the current page, you need clarification or additional context, or you want to retrieve related documentation sections.